Natáčecí období: 2004 - 2005

Počet epizod: 20

 

Atlantská expedice, vedená Dr. Weirovou, přijíždí do Ztraceného
města Antiků a hned se nachází v zoufalé situaci, která je nutí
urychleně najít nové spojence. Ty naleznou v Athosianech, ale
zároveň si najdou mocné nepřátele – Wraithy. Odříznutí od Země
musí členové expedice přežít v nové galaxii, zatímco odhalují
tajemství antické technologie a hledají způsob, jak zničit Wraithy.
Major Sheppard složí tým skládající se z něj, Dr. Rodneyho McKaye,
poručíka Aidena Ford a vůdkyně Athosianů Teyly Emmagan. Tento tým
slouží jako vlajkový tým Atlantis. Na jedné z prvních misí si
vytvoří dalšího nepřítele v Geniích, lidské vojenské civilizaci
s technologickou vyspělostí 50. let 20. století USA. Série končí
dramatickým okamžikem, a to s Atlantis pod útokem tří wraithských
mateřských lodí.